System Navigator to potężne oprogramowanie do zarządzania plikami. Oprócz standardowych operacji jak kopiowanie, usuwanie, czy przenoszenie danych, pozwala również na tworzenie list ulubionych lokalizacji czy porównywanie katalogów pod względem ich właściwości. Istnieje także możliwość zamontowania dowolnego obrazu dysku.

Nie zabrakło wbudowanego narzędzia do nagrywania płyt, co może się okazać przydatne, gdy chcemy wypalić obraz lub jakikolwiek inny plik. System Navigator rozpakuje pliki skompresowane do formatów ZIP, RAR, 7Z i wielu innych.

Niejednokrotnie zdarza się, że duże pliki nie mogą zostać nagrane na płycie CD/DVD. Oprogramowanie pozwala na dzielenie tak obszernych danych na mniejsze fragmenty zdatne do nagrania na kilku nośnikach.

Tuż po zakończeniu instalacji, użytkownik proszony jest o wybór schematu kolorystycznego interfejsu, występującego w dwóch wariantach.