HDHacker jest niewielkim narzędziem zapisującym oraz odzyskującym uszkodzony sektor MBR lub sektor rozruchowy dysku logicznego. Program może zostać zastosowany chociażby do odzyskania utraconego menadżera uruchamiania jak np. LILO. HDHacker może być wykorzystany profilaktycznie, szczególnie gdy komputer jest narażony na ataki wirusów, które mogą go unieruchomić.