Mednafen to emulator licznych typów konsol, który może być uruchamiany także z poziomu wiersza poleceń. Program opiera się na bibliotekach OpenGL oraz SDL i pozwala na zapisywanie stanów gry, prowadzenie gry w trybie sieciowym, nakładanie filtrów graficznych czy przewijanie rozgrywki do przodu oraz wstecz. Otwieranie gier odbywa się z wiersza poleceń jak i Eksploratora Windows.

Istnieje także możliwość wykonania zrzutów ekranu (PNG), nagrywania wideo (QuickTime) jak i zapisywania dźwięku w formacie WAV. Nic nie stoi na przeszkodzie by wczytać gry zapisywane w archiwach GZIP oraz ZIP/PKZIP. Mednafen umożliwia kompleksowe remapowanie wirtualnych kontrolerów na klawisze klawiatury.

Wśród obsługiwanych platform znajdziemy m.in.: Atari Lynx, Neo Geo Pocket (Color), WonderSwan, GameBoy (Color), GameBoy Advance, Nintendo Entertainment System, Super Nintendo Entertainment System/Super Famicom, Virtual Boy, PC Engine/TurboGrafx 16 (CD), SuperGrafx, PC-FX,  Sega Game Gear, Sega Genesis/Megadrive,  Sega Master System, Sony PlayStation.