Atlas Reactor to strategia turowa, której akcja została osadzona w futurystycznej metropolii, gdzie toczy się zażarta walka pomiędzy funduszami inwestycyjnymi dążącymi do przejęcia kontroli nad miastem. Pracownicy tych funduszy wynajmują najemników, którzy toczą ze sobą pojedynki. W rolę najemników wcielają się gracze.

Fabuła Atlas Reactor sprowadza się do turowych potyczek pomiędzy drużynami składającymi się z kilku wojowników, których można wybrać z galerii. Każdy z nich posiada zestaw swoich unikalnych cech i umiejętności.

W czasie bitwy na mapie pojawiają się różnego rodzaju przedmioty oraz bonusy, których zdobycie wiąże się z dużym ryzykiem. Warto dodać, że istnieje możliwość walki zarówno z innymi ludźmi jak i z botami.